Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rfc5Q9D0F6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rfc5Q9D0F6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rfc5Q9D0F6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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