Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms