Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prkrip1Q9CWV6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms