Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9CWU4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms