Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NubplQ9CWD8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms