Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdm1Q9CQK3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdm1Q9CQK3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms