Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms