Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg3Q9CPX6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms