Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GpnmbQ99P91 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms