Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NsmfQ99NF2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms