Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Hdac9Q99N13 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac9Q99N13 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
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Hdac9Q99N13 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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