Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp1b4Q99ME6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp1b4Q99ME6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms