Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprtQ99M80 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms