Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp16Q99LG0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms