Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Hps4Q99KG7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hps4Q99KG7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms