Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ddb2Q99J79 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Ddb2Q99J79 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ddb2Q99J79 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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