Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Apobec3Q99J72 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms