Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Slc8b1Q925Q3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Slc8b1Q925Q3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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