Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clip1Q922J3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms