Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb6Q922F4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb6Q922F4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms