Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Creb3l3Q91XE9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Creb3l3Q91XE9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Creb3l3Q91XE9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Creb3l3Q91XE9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Creb3l3Q91XE9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Creb3l3Q91XE9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Creb3l3Q91XE9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Creb3l3Q91XE9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Creb3l3Q91XE9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms