Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ppargc1bQ8VHJ7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms