Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cabp4Q8VHC5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cabp4Q8VHC5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms