Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MyripQ8K3I4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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