Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf39Q8K2Z2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf39Q8K2Z2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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