Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lrit1Q8K099 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrit1Q8K099 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms