Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkn3Q8K045 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms