Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rasgef1bQ8JZL7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rasgef1bQ8JZL7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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