Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trip10Q8CJ53 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms