Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim32Q8CH72 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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