Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hpf1Q8CFE2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms