Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms