Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms