Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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