Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ephb1Q8CBF3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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