Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fbxo48Q8CAT8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fbxo48Q8CAT8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fbxo48Q8CAT8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fbxo48Q8CAT8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fbxo48Q8CAT8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fbxo48Q8CAT8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms