Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek11Q8C0Q4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms