Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ctdsp2Q8BX07 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms