Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp38Q8BW70 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Usp38Q8BW70 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
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Usp38Q8BW70 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp38Q8BW70 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp38Q8BW70 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp38Q8BW70 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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