Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp43Q8BUM9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Usp43Q8BUM9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp43Q8BUM9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp43Q8BUM9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp43Q8BUM9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp43Q8BUM9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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