Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cep55Q8BT07 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms