Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ubash3bQ8BGG7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms