Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms