Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ttc28Q80XJ3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ttc28Q80XJ3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ttc28Q80XJ3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Ttc28Q80XJ3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
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Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ttc28Q80XJ3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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