Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc155Q80VJ8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms