Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NischQ80TM9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NischQ80TM9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
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