Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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LnpkQ7TQ95 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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LnpkQ7TQ95 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms