Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim12Q78RX3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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