Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx13Q6PHS6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms