Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vstm2lQ6PDS0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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